Mã số nội bộ của iPhone 5se là N69. Chiếc iPhone 4 inch này sẽ chạy chip A8 và chip đồng xử lý chuyển động M8. Sự kết hợp này đã từng xuất hiện trên chiếc iPhone và iPhone 6 Plus.

Camera chính của sản phẩm có độ phân giải 8MP,ếciPhoneinchsẽcótênsechạtinthethao camera trước có độ phân giải 1,2MP.  Đây cũng chính là bộ đôi camera xuất hiện trên chiếc iPhone 6. Model này cũng có khả năng trình diễn ảnh Live Photos. Đây là tính năng quay lại một đoạn video dài 1,5 giây trước và sau khi màn trập chụp lại bức ảnh. Kết quả sẽ là một đoạn clip dài 3 giây xuất hiện trên ảnh. Camera của 5se cũng hỗ trợ những bức ảnh toàn cảnh kích thước lớn hơn và chế độ tự lấy nét khi quay video.